pI/Mw批量计算工具(PItool) 1.0
软件介绍:
本工具可通过互联网向Expasy数据库批量提交蛋白质等电点及分子量计算请求,并即时接收计算结果。
使用方法及技巧
方法一:输入Swiss-Prot蛋白质识别号(ID)(如TVB5_MOUSEPEPC_HUMAN)或Swiss-Prot/TrEMBL登录号(AC)(如P04213P20142),用“空格”分开,或一行一个。
例如:输入以下内容并提交......
按照方法一的方式,只提交一个蛋白质的Swiss-Prot蛋白质识别号(ID)或Swiss-Prot/TrEMBL登录号(AC)时,除返回等电点及分子量外,还将获得有关局部片段参考信息。
例如,输入ALBU_HUMAN并提交,将返回以下内容......
方法二:直接输入蛋白质的序列(单字母)。
例如,输入:
EQLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNIWATHACVPTDPNPQEVVLGNVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLWDQSLKPCVK
LTPLCVTLNCTNLRNDTSTNATNTTSSNRGKMEGGEMTNCSFNITTSIRSKVQKEYALFYKLDVVPIDNT
SYTLINCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCA
将输出以下结果:
TheoreticalpI/Mwfortheproteinsequence
EQLWVTVYYG...FEPIPIHYCA:
TheoreticalpI/Mw:5.14/21386.24
在“方法三”前的复选框内打钩,输入某个蛋白的AC、所求序列片段的起始位置(从N段算起)、结束位置,提交后将返回此片段的分子量及等电点,并配有所求片段的序列及适当的注释。为保证等电点计算的相对准确,片段长度不宜小于5个氨基酸残基。
(详见说明文档)
使用方法及技巧
方法一:输入Swiss-Prot蛋白质识别号(ID)(如TVB5_MOUSEPEPC_HUMAN)或Swiss-Prot/TrEMBL登录号(AC)(如P04213P20142),用“空格”分开,或一行一个。
例如:输入以下内容并提交......
按照方法一的方式,只提交一个蛋白质的Swiss-Prot蛋白质识别号(ID)或Swiss-Prot/TrEMBL登录号(AC)时,除返回等电点及分子量外,还将获得有关局部片段参考信息。
例如,输入ALBU_HUMAN并提交,将返回以下内容......
方法二:直接输入蛋白质的序列(单字母)。
例如,输入:
EQLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNIWATHACVPTDPNPQEVVLGNVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLWDQSLKPCVK
LTPLCVTLNCTNLRNDTSTNATNTTSSNRGKMEGGEMTNCSFNITTSIRSKVQKEYALFYKLDVVPIDNT
SYTLINCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCA
将输出以下结果:
TheoreticalpI/Mwfortheproteinsequence
EQLWVTVYYG...FEPIPIHYCA:
TheoreticalpI/Mw:5.14/21386.24
在“方法三”前的复选框内打钩,输入某个蛋白的AC、所求序列片段的起始位置(从N段算起)、结束位置,提交后将返回此片段的分子量及等电点,并配有所求片段的序列及适当的注释。为保证等电点计算的相对准确,片段长度不宜小于5个氨基酸残基。
(详见说明文档)
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中检索"pI/Mw批量计算工具(PItool) 1.0"
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